Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hoxd10P28359 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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