Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U2af2P26369 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U2af2P26369 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms