Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NdnP25233 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NdnP25233 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NdnP25233 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NdnP25233 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NdnP25233 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NdnP25233 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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NdnP25233 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NdnP25233 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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