Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkchP23298 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkchP23298 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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