Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prim1P20664 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prim1P20664 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prim1P20664 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms