Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms