Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtpraP18052 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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PtpraP18052 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtpraP18052 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtpraP18052 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtpraP18052 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtpraP18052 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PtpraP18052 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtpraP18052 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PtpraP18052 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtpraP18052 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PtpraP18052 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtpraP18052 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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PtpraP18052 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtpraP18052 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtpraP18052 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtpraP18052 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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PtpraP18052 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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PtpraP18052 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PtpraP18052 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PtpraP18052 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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PtpraP18052 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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