Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FosbP13346 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FosbP13346 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FosbP13346 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FosbP13346 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FosbP13346 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FosbP13346 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FosbP13346 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FosbP13346 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FosbP13346 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FosbP13346 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FosbP13346 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FosbP13346 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FosbP13346 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FosbP13346 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FosbP13346 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FosbP13346 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FosbP13346 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FosbP13346 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FosbP13346 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FosbP13346 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FosbP13346 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms