Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms