Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms