Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ccl2P10148 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms