Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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