Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01853 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01853 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01853 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01853 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01853 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01853 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01853 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01853 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01853 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01853 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01853 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01853 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01853 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01853 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01853 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01853 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01853 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01853 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01853 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01853 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01853 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01853 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01853 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01853 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01853 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms