Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sp1O89090 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sp1O89090 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sp1O89090 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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