Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BlmO88700 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BlmO88700 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BlmO88700 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BlmO88700 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms