Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sap30O88574 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms