Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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AurkcO88445 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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AurkcO88445 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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AurkcO88445 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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AurkcO88445 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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AurkcO88445 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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AurkcO88445 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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AurkcO88445 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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AurkcO88445 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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AurkcO88445 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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AurkcO88445 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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AurkcO88445 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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AurkcO88445 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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