Protein–RNA interactions for Protein: O88282

Bcl6b, B-cell CLL/lymphoma 6 member B protein, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl6bO88282 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Bcl6bO88282 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Bcl6bO88282 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Bcl6bO88282 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Bcl6bO88282 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Bcl6bO88282 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Bcl6bO88282 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms