Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ldb2O55203 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ldb2O55203 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ldb2O55203 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ldb2O55203 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ldb2O55203 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ldb2O55203 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ldb2O55203 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ldb2O55203 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ldb2O55203 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ldb2O55203 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ldb2O55203 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ldb2O55203 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms