Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Cited2O35740 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Cited2O35740 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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