Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atf6bO35451 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atf6bO35451 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atf6bO35451 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atf6bO35451 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atf6bO35451 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atf6bO35451 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atf6bO35451 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atf6bO35451 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atf6bO35451 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atf6bO35451 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atf6bO35451 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atf6bO35451 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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