Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnk3O35111 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms