Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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PbsnO08976 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PbsnO08976 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PbsnO08976 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PbsnO08976 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PbsnO08976 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PbsnO08976 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PbsnO08976 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PbsnO08976 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PbsnO08976 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PbsnO08976 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PbsnO08976 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PbsnO08976 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PbsnO08976 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PbsnO08976 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms