Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sema3aO08665 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms