Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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