Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm5225J3QPL3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm5225J3QPL3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm5225J3QPL3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm5225J3QPL3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm5225J3QPL3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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