Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms