Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms