Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atf6F6VAN0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atf6F6VAN0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atf6F6VAN0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atf6F6VAN0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atf6F6VAN0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atf6F6VAN0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atf6F6VAN0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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