Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms