Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20425E9Q035 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20425E9Q035 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20425E9Q035 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20425E9Q035 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20425E9Q035 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20425E9Q035 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20425E9Q035 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20425E9Q035 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20425E9Q035 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms