Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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