Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsf1E9PWW9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms