Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms