Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms