Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apba1B2RUJ5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apba1B2RUJ5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms