Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN2

Igsf23, Immunoglobulin superfamily, member 23, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf23B2RTN2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Igsf23B2RTN2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms