Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Trabd2bB1ATG9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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