Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms