Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Scn3aA2ASI5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Scn3aA2ASI5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Scn3aA2ASI5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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