Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms