Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms