Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Speer3W4VSP1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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