Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms