Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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