Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ccl8Q9Z121 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ccl8Q9Z121 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ccl8Q9Z121 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ccl8Q9Z121 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ccl8Q9Z121 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl8Q9Z121 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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