Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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