Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms