Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms