Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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VapbQ9QY76 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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VapbQ9QY76 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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VapbQ9QY76 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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VapbQ9QY76 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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VapbQ9QY76 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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VapbQ9QY76 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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VapbQ9QY76 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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VapbQ9QY76 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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VapbQ9QY76 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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